值得注意的是，與對(duì)照組相比，NOX4的升高增加了鐵的積累，這是鐵死亡的特異性標(biāo)志(圖7D)。接下來，我們使用3D分析儀分析NOX4上調(diào)后人星形膠質(zhì)細(xì)胞細(xì)胞毒性的形態(tài)學(xué)變化(圖7E)。相對(duì)于對(duì)照，NOX4的升高誘導(dǎo)了細(xì)胞毒性的形態(tài)學(xué)特征，包括細(xì)胞質(zhì)面積縮小和起泡(圖7E)。此外，與對(duì)照組相比，NOX4升高后，形態(tài)死亡細(xì)胞數(shù)量***增加(圖7F)。與形態(tài)學(xué)分析結(jié)果一致，相對(duì)于對(duì)照，NOX4的升高***增加了細(xì)胞毒性水平(圖7G)。這些結(jié)果表明，NOX4通過氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的人星形膠質(zhì)細(xì)胞脂質(zhì)過氧化促進(jìn)了鐵死亡。 結(jié)論：NOX4通過線粒體代謝損傷，氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的脂質(zhì)過氧化作用促進(jìn)星形膠質(zhì)細(xì)胞的...

現(xiàn)今研究表明tRNA-derivedsmallnoncodingRNAs（sncRNAs）主要分為兩類：tRNAhalves(tiRNAs)和fragments(tRFs)。前者在人類實(shí)體**中的的生物學(xué)功能吸引了越來越多的關(guān)注，但是其在**發(fā)生中的生物學(xué)機(jī)制仍知之甚少。tiRNAs和剪切相關(guān)蛋白之間的相關(guān)作用更是為未可知。本研究***發(fā)現(xiàn)一個(gè)5’-tRNAhalves，即tiRNA-Gly通過與RBM17結(jié)合誘導(dǎo)可變剪切進(jìn)而促進(jìn)**狀甲狀腺*（PTC）的增殖和遷移。本文于2021年7月發(fā)表在影響因子7.068的《JournalofExperimentalandClinicalCancerRe...

特色lncRNA基因 LncExpDB 表征了在特定細(xì)胞系/組織中特異性表達(dá)、在**或病毒***背景下差異表達(dá)、在特定細(xì)胞器中富集、在細(xì)胞分化或胚胎/***發(fā)育過程中動(dòng)態(tài)表達(dá)或隨晝夜節(jié)律周期性表達(dá)的特征 lncRNA 基因韻律。基于大量RNA-seq數(shù)據(jù)，共鑒定出25191個(gè)特征lncRNA，其中***發(fā)育7922個(gè)，正常組織/細(xì)胞系7498個(gè)，亞細(xì)胞定位5292個(gè)，植入前胚胎4343個(gè)，*細(xì)胞系2907個(gè)，1740個(gè)晝夜節(jié)律，外泌體中為 1538，細(xì)胞分化中為 1232，病毒***中為 985。 LncRNA-mRNA相互作用 為了促進(jìn)對(duì)特征 lncRNA 分子機(jī)制的深...

2021年，來自加拿大多倫多大學(xué)和加拿大溫哥華英屬哥倫比亞大學(xué)等團(tuán)隊(duì)合作在Naturecommunication雜志上發(fā)表了文章“BiologicalandtherapeuticimplicationsofauniquesubtypeofNPM1mutatedAML.”。此報(bào)道描述了npm1突變AML患者的分子異質(zhì)性。基于rna-seq的基因表達(dá)譜分析，確定了兩種新亞型，稱為原始型和committed型。基于基因表達(dá)、表觀基因組(ATAC-seq)和免疫表型(CyToF)的差異，在**的AML隊(duì)列中將亞型與特定的分子特征、疾病分化狀態(tài)和患者生存聯(lián)系起來。此外，表明了在缺乏FLT3-ITD的原始...

PTEN包含一個(gè)n端磷酸酶結(jié)構(gòu)域，它可以使脂質(zhì)細(xì)胞膜的一種成分——磷脂酰肌醇3,4,5-三磷酸(PI(3,4,5)P3或PIP3)去磷酸化。PTEN通過去磷酸化PIP3的D3位，拮抗磷脂酰肌苷3-激酶(PI3K)通路。PI3K通路調(diào)節(jié)多種細(xì)胞過程，包括細(xì)胞代謝、存活、增殖、凋亡、生長(zhǎng)和遷移。這些基本的細(xì)胞過程，當(dāng)解除控制時(shí)，可以促進(jìn)或驅(qū)動(dòng)惡性表型。 PTEN功能突變的體細(xì)胞丟失在多種人類**中被發(fā)現(xiàn)，包括乳腺*、子宮內(nèi)膜*、多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤、皮膚*和前列腺*。PTEN缺失是乳腺*中常見的事件，與加速進(jìn)展和不良預(yù)后密切相關(guān)。特別是PTEN的表達(dá)已經(jīng)被提出在人表皮生長(zhǎng)因子受體2(HER...

為了驗(yàn)證MAO-A缺乏是否直接有助于減輕Maoa KO巨噬細(xì)胞的免疫抑制極化，進(jìn)行拯救實(shí)驗(yàn)。構(gòu)建MIG-Maoa逆轉(zhuǎn)錄病毒載體，利用該載體轉(zhuǎn)導(dǎo)Maoa KO BMDMs，并在這些巨噬細(xì)胞中實(shí)現(xiàn)了MAO-A的過表達(dá)（圖3l-n）。MAO-A過表達(dá)***加劇了IL-4/ IL-13刺激的Maoa KO BMDMs的免疫抑制表型（圖3o-p）。綜上所述，這些結(jié)果表明，MAO-A作為一種自主因子，在***刺激下促進(jìn)巨噬細(xì)胞免疫抑制極化。 4、MAO-A通過ROS上調(diào)促進(jìn)巨噬細(xì)胞免疫抑制極化 接下來，研究調(diào)控MAO-A促進(jìn)巨噬細(xì)胞免疫抑制極化的分子機(jī)制。據(jù)報(bào)道，細(xì)胞內(nèi)活性氧(RO...

流式檢測(cè)TAM的標(biāo)志物表達(dá)，結(jié)果顯示MAO-A缺陷小鼠表現(xiàn)出更少的免疫抑制表型，即免疫抑制標(biāo)志物CD206表達(dá)***下調(diào)，而免疫刺激分子CD9，CD86和MHC class II I-Ab的表達(dá)上調(diào)（圖1e-h）。進(jìn)一步的分析顯示，來自Maoa KO小鼠的TAMs免疫抑制相關(guān)基因表達(dá)水平降低，如Mrc1，Chi3l3和Arg1（圖1i），而免疫刺激相關(guān)基因表達(dá)上調(diào)，如Il6，Tnfα和Ccl2（圖1j）。作者對(duì)野生型和Maoa KO小鼠進(jìn)行單細(xì)胞測(cè)序，分析了**浸潤(rùn)免疫細(xì)胞（TIIs）。結(jié)果顯示TIIs由六種細(xì)胞組成，即TAM/Mono, T cell, NK cell, B cell, DC...

QKI促進(jìn)NSCLC細(xì)胞中circNDUFB2的生物發(fā)生 circNDUFB2和NDUFB2均來自NDUFB2 pre-mRNA，而NDUFB2 mRNA在NSCLC中略有上調(diào)。因此，推測(cè)circNDUFB2的下調(diào)在轉(zhuǎn)錄后發(fā)生。我們?cè)赾ircNDUFB2中搜索與潛在QRE匹配的序列。接下來進(jìn)行了RIP分析，確認(rèn)QKI確實(shí)與NDUFB2 pre-mRNA中的假定QRE結(jié)合。在NSCLC細(xì)胞中QKI過表達(dá)可能會(huì)上調(diào)circNDUFB2。 這些數(shù)據(jù)表明，QKI與NDUFB2 pre-mRNA的circNDUFB2形成外顯子側(cè)翼的內(nèi)含子結(jié)合，從而促進(jìn)circNDUFB2的形成。 外泌體miR...

1、白樺素作為SREBP加工特異性抑制劑的鑒定 構(gòu)建了一個(gè)由含SRE啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)的熒光素酶報(bào)告基因，并從人肝*細(xì)胞系Huh-7中生成了穩(wěn)定表達(dá)該報(bào)告基因的細(xì)胞系(命名為Huh-7/SRE-Luc)。然后將該細(xì)胞與不同化合物孵育，并進(jìn)行熒光素酶活性測(cè)定。有趣的是，只有白樺素[lup-20(29)-ene-3b,28-diol]有效降低了熒光素酶的活性。白樺素是一種天然存在的五環(huán)三萜，可以很容易地從樺樹皮中提取出來(比較高可達(dá)干重的30%)。 作者直接檢測(cè)了白樺素對(duì)SREBP加工的影響和特異性，并與25-HC進(jìn)行比較。25-HC有三個(gè)主要作用：通過抑制SREBP-2的切割降低n-SR...

急性髓系白血病(AML)是一種基因和生物學(xué)上的異質(zhì)性疾病，其特征是克隆擴(kuò)增和突變的造血干細(xì)胞和祖細(xì)胞分化受損。在AML**常見的驅(qū)動(dòng)突變中，NPM1基因第12外顯子的4堿基對(duì)插入是穩(wěn)定的，在20%-30%的病例中發(fā)生。由于其生物學(xué)意義和預(yù)后影響，NPM1突變?cè)谑澜缧l(wèi)生組織(WHO)的髓性白血病分類中**了一個(gè)獨(dú)特的白血病實(shí)體，并在預(yù)后和***決策中發(fā)揮重要作用。NPM1突變通常與誘導(dǎo)和鞏固化療后患者生存的良好影響相關(guān)。在NPM1突變的AML中，F(xiàn)LT3-ITD突變經(jīng)常與DNMT3A突變同時(shí)發(fā)生，這本身與接受標(biāo)準(zhǔn)誘導(dǎo)***的患者預(yù)后更差有關(guān)。大多數(shù)關(guān)于NPM1突變的AML的研究都集中在其他突變的...

我們接下來試圖識(shí)別circPDE4B上游調(diào)節(jié)器。我們首先對(duì)circPDE4B側(cè)翼序列進(jìn)行RNA pull-down-MS檢測(cè)，發(fā)現(xiàn)兩個(gè)與RNA剪接相關(guān)的RBP，包括DExH-box helicase 9和FUS(圖1G)。RT-qPCR結(jié)果顯示，F(xiàn)US敲除后，HCs中circPDE4B表達(dá)下調(diào)，而pPDE4B和mPDE4B沒有明顯變化(圖1H)。此外，***兩種FUS shRNA慢病毒只降低了circPDE4B的表達(dá)(圖1I)，而過表達(dá)FUS則上調(diào)了circPDE4B的表達(dá)(圖1I)。接下來，RIP分析顯示FUS與外顯子相鄰的位點(diǎn)結(jié)合，而其他遠(yuǎn)端位點(diǎn)則可以忽略(圖1J，K)。我們還尋找了可能的...

5.ELNAT1與UBC9啟動(dòng)子形成DNA-RNA三聯(lián)體，通過招募hnRNPA1增強(qiáng)H3K4me3修飾 為了探索ELNAT1誘導(dǎo)BCa淋巴轉(zhuǎn)移的分子機(jī)制，我們使用NGS檢測(cè)過表達(dá)ELNAT1的BCa細(xì)胞和對(duì)照細(xì)胞（Figure5A），由于SUMOylation已經(jīng)被證明可以調(diào)節(jié)特異性RNA的識(shí)別，并參與RNA分選進(jìn)入EVs的過程，因此鑒定ELNAT1的SUMOylation相關(guān)靶基因。在受ELNAT1調(diào)控的925個(gè)基因中，作者發(fā)現(xiàn)UBC9是SUMOylation相關(guān)基因變化*****的（Figure5B-D）。接著通過RNA純化（ChIRP）檢驗(yàn)ELNAT1與UBC9中P1（153~...

鑒于以上結(jié)果，作者想進(jìn)一步探究tiRNA-Gly與RBM17作用的分子結(jié)果。結(jié)果顯示，tiRNA-Gly可提高總RBM17蛋白的水平，但是不影響RBM17的mRNA水平（圖3H-I）。隨后，用蛋白質(zhì)合成抑制劑環(huán)己胺(CHX)處理細(xì)胞，tiRNA-Gly轉(zhuǎn)染后增加了K1細(xì)胞內(nèi)源性RBM17蛋白的半衰期，而β-actin作為對(duì)照（圖3J）。此外，蛋白酶體抑制劑MG132處理后，內(nèi)源性RBM17在轉(zhuǎn)染tiRNA-Gly的K1細(xì)胞中的積累量**高于轉(zhuǎn)染siRNA-NC的K1細(xì)胞，表明tiRNA-Gly抑制了蛋白酶體依賴性的PTC細(xì)胞中RBM17的降解（圖3K）。此外，tiRNA-Gly的過表達(dá)***抑...

7）SsD克服了m6A介導(dǎo)的白血病對(duì)酪氨酸激酶抑制劑的耐藥性 由于FTO抑制使耐藥細(xì)胞對(duì)酪氨酸激酶抑制劑（TKI）***敏感，我們檢測(cè)了SsD對(duì)TKI耐藥細(xì)胞的療效。我們發(fā)現(xiàn)SsD聯(lián)合尼洛替尼或PKC412在降低細(xì)胞活力方面更有效(圖7A)，這表明SsD***抑制了Kas-1NR和MV4-11PR細(xì)胞的增殖。細(xì)胞的分子特征也顯示TKIS介導(dǎo)的m6A低甲基化被挽救(圖7B-C)。雖然SsD沒有改變Kas-1NR和MV4-11PR細(xì)胞中ALKBH5、METTL3、YTHDF2的蛋白水平(圖7D)，但TKI上調(diào)的m6A相關(guān)基因MerTK、BCL-2和STAT3的表達(dá)受損(圖7E)。與上述結(jié)...

MAD2和p31conmet的結(jié)構(gòu)相似性突出了RIT1的潛在結(jié)合競(jìng)爭(zhēng)。因此，我們使用了競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合試驗(yàn)，其中滴定MAD2野生型(WT)或R133E/Q134A(RQ)，一個(gè)二聚體和p31結(jié)合缺陷的突變體，未能抑制rit1-p31conmet結(jié)合(圖1E)。由于RIT1g結(jié)構(gòu)域與其他Ras-GTPases，特別是它的鄰域RIT2之間的相似性，假設(shè)RIT1s的n端或c端延伸可能介導(dǎo)與MAD2和p31conmet的相互作用(圖1F)。隨后分析了RIT1N-或c-末端缺失突變體，證明了c-末端結(jié)構(gòu)域?qū)τ贛AD2和p31conmet星結(jié)合是必要和充分的(圖1G、1H和S1J)。m6A表達(dá)水平較高的**患者淋...

本文在一組臨床定義明確的SLE伴活檢證實(shí)的腎炎患者中進(jìn)行的T細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)和代謝研究表明，高IFN信號(hào)可驅(qū)動(dòng)CD8 + T細(xì)胞線粒體代謝途徑的變化，使其生物能量不適應(yīng)且更容易死亡。本文證明在SLE患者的CD8 + T細(xì)胞中觀察到的代謝重編程是延長(zhǎng)IFNα暴露和TCR刺激的結(jié)果。在這兩種刺激的持續(xù)組合下，這可能是SLE患者特有的一種情況，CD8 + T細(xì)胞表現(xiàn)出與NAD + 消耗增強(qiáng)、線粒體氧化能力降低和存活率下降相關(guān)的PARP基因表達(dá)增加（圖7)。總的來說，本文的發(fā)現(xiàn)證明高ISG特征與SLE CD8 + T細(xì)胞的代謝適合性之間的聯(lián)系，以及它們?cè)趬毫ο禄驅(qū)乖偌ぐl(fā)的反應(yīng)中存活的能力。思路是您的操...

轉(zhuǎn)錄組學(xué) (RNA-Seq) 模塊 RNA-seq 模塊對(duì)與衰老相關(guān)的全基因組轉(zhuǎn)錄組變化進(jìn)行編目。RNA-seq 模塊中收集的數(shù)據(jù)集來自與衰老研究相關(guān)的已發(fā)表文章。該模塊收集在特定基因干預(yù)（過表達(dá)、敲除等）時(shí)觀察到的轉(zhuǎn)錄組變化，該模塊還收集特定組織和***在生理和病理衰老過程中基因表達(dá)譜的變化。RNA-seq 模塊目前包含 > 18 000 個(gè)可能與衰老有關(guān)的差異表達(dá)基因 (DEG)。在 RNA-seq 模塊中，可以通過基因名稱輕松搜索 DEG，并且每個(gè) DEG 條目都包含潛在的實(shí)驗(yàn)條件和基因表達(dá)的倍數(shù)變化及其發(fā)布的來源。可以下載每篇文章中的所有搜索結(jié)果和相應(yīng)的DEG數(shù)據(jù)庫(kù)。 大黃酸...

熒光原位雜交和核胞質(zhì)RNA分?jǐn)?shù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示，MIR210HG在Ishikawa細(xì)胞和HEC-1A細(xì)胞中均位于核和細(xì)胞質(zhì)內(nèi)(圖3D和3E)。我們假設(shè)MIR210HG對(duì)miRNAs起海綿作用。為了探究MIR210HG是否參與了一個(gè)新的MIR210HG- miRNA -HMGA2調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，我們使用TargetScan、miRanda、CLIP-Seq和miRDB生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)來預(yù)測(cè)與HMGA2結(jié)合的mirna(圖3F)。選擇3個(gè)軟件程序分析交叉處的miRNAs作為候選miRNAs。通過將野生型雙熒光素酶載體介導(dǎo)的HMGA2構(gòu)建物共轉(zhuǎn)染HEK293T細(xì)胞，共鑒定和篩選了110個(gè)miRNAs。轉(zhuǎn)染后，...

與CD44v6敲低實(shí)驗(yàn)的結(jié)果相似，敲低Pex中的C1QBP在很大程度上抑制了α-SMA表達(dá)(圖6H)。過表達(dá)C1QBP并沒有上調(diào)α-SMA的表達(dá)(圖6I)。同時(shí)過表達(dá)CD44v6和C1QBP***增加了α-SMA的表達(dá)(圖6I)。與我們的體外研究一致，敲除Pex中的CD44v6或C1QBP逆轉(zhuǎn)了Pex誘導(dǎo)的HSC***、肝臟剛度增加和肝臟ECM重塑的作用(圖6J-L)。脾內(nèi)注射肝轉(zhuǎn)移模型(圖6M)顯示，與Pex組相比，注射了CD44v6-kd或C1QBP-kd的Pex組小鼠的肝轉(zhuǎn)移減少。這些結(jié)果表明，Pex衍生的CD44v6/C1QBP復(fù)合物介導(dǎo)了Pex對(duì)肝纖維化和PDAC肝轉(zhuǎn)移的積極作用。英...

耗盡的**內(nèi)T細(xì)胞會(huì)經(jīng)歷嚴(yán)重的缺氧 雖然缺氧在**中很常見，但尚不清楚**內(nèi)T細(xì)胞亞群是否比其他T細(xì)胞更容易缺氧。我們首先在8-10 mm(第14天)B16黑色素瘤中沿著衰竭譜對(duì)CD8+**浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞(TILs)進(jìn)行表型分析(擴(kuò)展數(shù)據(jù)圖1a)。**終衰竭的T細(xì)胞被定義為高水平和持續(xù)表達(dá)PD-1和共表達(dá)Tim-3(圖1a)，具有高的LAG3和Tox表達(dá)，低的TCF1表達(dá)，通過將gp100特異的Pmel-1 T細(xì)胞轉(zhuǎn)移到攜帶b16的小鼠中，一旦它們達(dá)到**終衰竭，就會(huì)重新刺激它們，從而測(cè)定抗原特異性反應(yīng)(擴(kuò)展數(shù)據(jù)圖1b)。與LN-resident Pmel-1 T細(xì)胞相比，gp100-...

使用SmartSeq2協(xié)議對(duì)15個(gè)胎兒的單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行scRNA-seq處理（圖1a）。基于差異表達(dá)(DE)分析和按標(biāo)準(zhǔn)化表達(dá)***性排序的前20個(gè)標(biāo)記基因。紅細(xì)胞(表達(dá)HBG1、HBA1、GYPA和ALAS2)、mk(表達(dá)FLI1、ITGA2B和GP9)、單核細(xì)胞祖細(xì)胞和單核細(xì)胞(表達(dá)CD14、MPEG1和CD33)、CD4+單核細(xì)胞、肥大細(xì)胞(表達(dá)CD63、GATA2和HDC)、漿細(xì)胞樣樹突狀細(xì)胞(pDCs;表達(dá)IL3RA,IRF8,MPEG1和JCHAIN)和另一簇高循環(huán)pDCs(表達(dá)pDC和增殖標(biāo)記物;例如，MKI67)和粒細(xì)胞1、2和3(表達(dá)AZU1、MPO和PRTN3)(圖1B)單細(xì)...

此外，GFP-INPP4B的表達(dá)在基礎(chǔ)和wnt刺激條件下降低了GSK3β蛋白水平，與GSK3β的增強(qiáng)破壞一致(圖6d)。通過HrsshRNA消耗抑制晚期核內(nèi)體形成后，降低的GSK3β蛋白水平得以恢復(fù)(圖6f,g)。GFP-INPP4B而不是gfp載體細(xì)胞表現(xiàn)出明顯的GSK3β蛋白酶保護(hù)，這與GSK3β向晚期核內(nèi)體轉(zhuǎn)運(yùn)的增強(qiáng)相一致(圖6h)。免疫熒光證實(shí)了這一點(diǎn)，在GFP-INPP4B中觀察到RFP-GSK3與LysoTracker共定位，這是一種積累在晚期核內(nèi)體/溶酶體中的染料，而不是gfp載體細(xì)胞(圖6i)。英拜跟客戶形成產(chǎn)學(xué)研合作模式。重慶神經(jīng)炎癥科研點(diǎn)擊該結(jié)構(gòu)的圖像可以獲得放大的圖像。為...

1）circMAPK1的鑒定和circMAPK1的臨床特征 由于MAPK信號(hào)通路在**發(fā)生和進(jìn)展中起著重要的病理作用，我們首先根據(jù)在線數(shù)據(jù)庫(kù)circBase中的circRNA測(cè)序數(shù)據(jù)分析了來自MAPK通路相關(guān)基因的circRNA。然后我們清點(diǎn)了MAPK通路相關(guān)的circRNAs，發(fā)現(xiàn)大部分細(xì)胞系可以表達(dá)數(shù)以百計(jì)的MAPK通路的circRNAs(圖1a)。在來源于MAPK1的circRNA中，circ-0006203、circ0004872和circ-0008870在超過三個(gè)**的測(cè)序數(shù)據(jù)集中被***檢測(cè)。我們利用qRT-PCR檢測(cè)了這三種circRNA在胃*患者的胃*組織和*旁組織中...

急性胰腺炎(AP)是**常見的炎癥性胃腸道疾病之一，在小鼠和人類模型中似乎通過外分泌腺泡細(xì)胞的再生而恢復(fù)。巨噬細(xì)胞是由組織損傷引發(fā)的炎癥和組織再生反應(yīng)的重要驅(qū)動(dòng)因素，包括***、自身免疫性疾病、機(jī)械或毒性損傷以及其他原因。在組織損傷時(shí)，骨髓(BM)衍生的巨噬細(xì)胞和/或組織駐留巨噬細(xì)胞被***并以促炎方式響應(yīng)局部環(huán)境，然后迅速轉(zhuǎn)變?yōu)閭谛迯?fù)表型。巨噬細(xì)胞的表型和作用已在急性和慢性胰腺炎中得到充分證明。然而，關(guān)于巨噬細(xì)胞如何調(diào)節(jié)損傷后的胰腺修復(fù)/再生，包括ADM和腺泡再分化，我們知之甚少。***講一篇關(guān)于巨噬細(xì)胞表型變化與AP炎癥相關(guān)的文章，該文章題名為：Macrophagephenotypics...

英拜生物是國(guó)內(nèi)承接各類高通量測(cè)序科研項(xiàng)目以及一站式的測(cè)序文章發(fā)表服務(wù)。 英拜公司以高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的生物實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，為您的科研添磚加瓦。英拜專業(yè)專注于國(guó)內(nèi)外醫(yī)學(xué)研究熱點(diǎn)，為廣大科研工作者提供課題設(shè)計(jì)。服務(wù)內(nèi)容:1.課題設(shè)計(jì)階段交流:了解客戶的研究方向以及所能提供的樣本類型和樣本量2.相關(guān)文獻(xiàn)查閱:根客戶的研究方向,查閱相關(guān)文獻(xiàn)3.設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)路線:根據(jù)客戶的要求和提供的樣本類型、樣本量設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)4.實(shí)驗(yàn)操作:按照實(shí)驗(yàn)方案實(shí)施實(shí)驗(yàn)5.整理實(shí)驗(yàn)結(jié)果:完成實(shí)驗(yàn),對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行整理6.數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析處理:對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行生物學(xué)分析7.論文:按照實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)路線和實(shí)驗(yàn)結(jié)...

我們已經(jīng)進(jìn)行了snATAC-seq和snRNA-seq來研究染色質(zhì)可及性如何改善我們對(duì)成熟人類腎臟中細(xì)胞狀態(tài)和功能的理解。我們生成了一個(gè)包含轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組數(shù)據(jù)的交互式多模態(tài)圖譜。結(jié)合snRNA-seq和snATAC-seq分析提高了檢測(cè)近端小管和厚升肢內(nèi)獨(dú)特細(xì)胞狀態(tài)的能力，并重新定義了可能有助于腎臟再生和細(xì)胞特異性離子通透性的細(xì)胞異質(zhì)性。 一、人類成年腎臟的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄和染色質(zhì)可及性分析 1）成人腎臟中的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄和染色質(zhì)可及性分析 snRNA-seq基于譜系特異性標(biāo)記的表達(dá)(圖1c，補(bǔ)充圖1b)，鑒定了腎皮質(zhì)內(nèi)所有主要細(xì)胞類型(圖1b，補(bǔ)充圖1a)。檢測(cè)了近端小管(P...

褪黑素可減輕TBI引起的鐵死亡 為了確定褪黑素是否可以挽救TBI引起的鐵死亡，在相應(yīng)的高峰表達(dá)（例如1天和3天）進(jìn)行了與鐵死亡相關(guān)蛋白的蛋白質(zhì)印跡分析。發(fā)現(xiàn)褪黑素給藥在TBI后1天抑制了TBI誘導(dǎo)的xCT，Cox2，Tfr1，F(xiàn)pn和Nox2蛋白表達(dá)的上調(diào)。同樣，褪黑素***在TBI后3天阻止了Fth，F(xiàn)tl和4HNE蛋白的表達(dá)。用促鐵蛋白抑制劑liproxstatin-1（Lip-1）也獲得了相似的結(jié)果。此外，免疫組化染色顯示，與對(duì)照組相比在TBI后第7天，褪黑素和Lip-1的處理減少了神經(jīng)元中4HNE陽性細(xì)胞的數(shù)量，表明褪黑素對(duì)TBI誘導(dǎo)的脂質(zhì)具有神經(jīng)保護(hù)作用過氧化。褪黑素和Li...

四、INPP4B促進(jìn)pi3kα依賴的晚期核內(nèi)體形成 五、阻斷atm依賴的磷酸化會(huì)損害DNA損傷后PTEN的亞細(xì)胞再分配 對(duì)MCF-7細(xì)胞內(nèi)溶酶體室的檢查顯示，GFP-INPP4B不影響eea1陽性的早期內(nèi)溶體，但***增加了cd63陽性的晚期內(nèi)溶體(2.5倍)和lamp1陽性的溶酶體(1.7倍)(圖4a,b)。 提示INPP4B促進(jìn)晚期內(nèi)吞體/溶酶體的形成。使用bsa-gold標(biāo)記MCF-7細(xì)胞內(nèi)溶酶體室，在電鏡下進(jìn)行超微結(jié)構(gòu)分析。GFP-INPP4B增加了類似晚期核內(nèi)體的bsa陽性空泡結(jié)構(gòu)的數(shù)量(圖4c)。利用染料淬滅的BSA(BSA-dq)檢測(cè)了運(yùn)往溶酶體的貨物運(yùn)輸，...

METTL3降低APC表達(dá)，促進(jìn)β-catenin介導(dǎo)的下游基因表達(dá)、有氧糖酵解、ESCC細(xì)胞增殖和**發(fā)展APC功能的喪失使β-連環(huán)蛋白穩(wěn)定，從而誘導(dǎo)下游基因（CCND1和MYC）的表達(dá)。CCND1促進(jìn)細(xì)胞周期，c-Myc增強(qiáng)有氧糖酵解。正如預(yù)期的那樣，METTL3缺失增強(qiáng)了KYSE180細(xì)胞中APC的表達(dá)，降低了β-連環(huán)蛋白、細(xì)胞CCND1、c-Myc和PKM2的表達(dá)。此外，METTL3缺失降低了葡萄糖攝取、乳酸產(chǎn)生、細(xì)胞增殖和細(xì)胞集落數(shù)。值得注意的是，這種METTL3缺失引起基因表達(dá)（圖6a）、糖酵解（圖6b，c）、細(xì)胞增殖（補(bǔ)充圖6f）和集落形成的抑制在很大程度上被這些細(xì)胞中的APC缺...

1）NOX4水平在阿爾茨海默病患者皮質(zhì)區(qū)受損星形膠質(zhì)細(xì)胞中升高 為了探討NOX4在AD患者星形膠質(zhì)細(xì)胞損傷中的作用，我們分析了AD患者大腦皮質(zhì)星形膠質(zhì)細(xì)胞中NOX4蛋白水平是否升高。我們采用免疫熒光染色法檢測(cè)AD患者或非AD供者(正常)顳葉皮質(zhì)組織GFAP陽性星形膠質(zhì)細(xì)胞中的NOX4蛋白水平(圖1A和B)。免疫熒光染色顯示AD患者皮質(zhì)區(qū)分子層GFAP陽性星形膠質(zhì)細(xì)胞中NOX4陽性染色強(qiáng)度相對(duì)于非AD供者增加(圖1A)。此外，AD患者皮質(zhì)區(qū)ML中受損的GFAP陽性星形膠質(zhì)細(xì)胞中的NOX4陽性染色強(qiáng)度高于非AD供者(圖1A和B)。值得注意的是，AD患者中NOX4與GFAP亞細(xì)胞共定位陽性...